何千年もの先の未来、ロボットしかいない世界「エデン3」で農業用ロボットとして暮らしていたE92とA37はある日、サラという名の赤ちゃんが入ったカプセルを発見し眠りから目覚めさせてしまう。人間を悪とみなしているこの世界ではサラが危険と考えた2体は、エデンの外にある安全な場所へ運び密かに育てていく。2体の元ですくすくと成長したサラは、ある日遠くから自分を呼ぶ声に気づく、それはあのロボットしかいないはずの「エデン3」からだった―