悪の組織・ヒドラは世界征服の野望を達成するための先兵して、三人の少年少女に遺伝子操作を施し、人工的な超人戦士を生み出すことに成功した。彼らはヒドラに「アベンジャーズは悪のヴィランだ」と教え込まれ、自分たちが正義のヒーローだと思っていたが、真実を知り、ヒドラからの脱走を図る。この過程で仲間の二人アディとクロエは捕えられてしまい、残った一人・マコトは、あえてアベンジャーズのメンバー・アイアンマンの元に飛び込み手を組む事を提案する（実態としては助けを求めた形）。

アベンジャーズはヒドラの拠点である絶海の孤島においてヒドラのボスであるレッド・スカルと交戦、窮地に陥るもマコトの機転もあり、アディとクロエは救出したが、マコトのバディだった少年ヴィラン・ブルーノは行方不明になってしまった。

ひとまず自由の身になった三人だが行く当てのない彼らを放り出す事は出来ない。アベンジャーズは当面のあいだ彼らを見守る事にした。そして三人も「本当の正義のヒーロー」になろうと決意しアベンジャーズに「弟子入り」。ここにルーキーヒーローチーム「フューチャー・アベンジャーズ」が誕生した。