マルコ・ポーロが残した旅行記「東方見聞録」に知られざる幻の1ページがあった…その「アナザーページ」を発見したテオ・アルジェント教授が何者かによって殺害。アナザーページは奪われてしまった。そして、容疑者としてルパン三世の名が浮かび上がる…。ルパンは警察に追われながら、アナザーページの行方と、それに纏わる謎に迫っていく。そんな中、殺害されたテオ・アルジェント教授の孫であるリサが、謎の組織に襲われているところを助けるルパン。ルパンは、リサの祖父を殺害した容疑者である事を隠しながら、リサと共に行動するのだった…。
リサを襲った組織とは？また、彼らの狙いは…？そして、マルコ・ポーロはアナザーページに一体何を書き記したのだろうか………?